Hola Agustí,
com et deia la gestió de fitxers és un dels canvis més importants al Moodle 2 i no es poden gestionar com abans, per tant, no pots entrar i organitzar les carpetes tal i com ho feies abans.
El que sí que podries fer és el que s'explica en aquest fil de debat, potser seria una forma de gestionar-ho: http://educaciodigital.cat/moodle/moodle/mod/forum/discuss.php?d=33965
Fins ara,
Mònica