Hola Agustí,
possiblement el problema sigui el còdec de compressió de l'àudio del vídeo. Pel que vist l'àudio està comprimit en MPEG-1 Layer 2 (MP2) i aquest format no està entre els formats suportats pel moodle-mplayer: https://code.google.com/p/moodle-mplayer/wiki/SupportedMediaTypes
Prova a desar el vídeo de nou comprimint l'àudio en MP3 a veure si així se sent correctament.
Fins ara,
Mònica